負責全縣新型農村合作醫療資金的測算、監管和使用;參合農民住院醫藥費的審核和報銷;參合農民家庭個人帳戶及門診報銷的審核;醫療單位住院窗口結算的審核和管理;各鄉鎮和醫療單位網絡建設管理和使用;參合農民個人檔案錄入及管理;新農合資金的預算及年終決算工作。